南京医药类大学排名第一的是中国药科大学，排名第二的是南京中医药大学，排名第三的是南京医科大学，以下是具体榜单一览表，希望对大家有所帮助。如有异议，还请以教育部、考试院等权威部门公布的信息为准。
| 序号 | 学校名称 | 省份 | 城市 | 双一流 |
| 1 | 中国药科大学 | 江苏 | 南京 | 是 |
| 2 | 南京中医药大学 | 江苏 | 南京 | 是 |
| 3 | 南京医科大学 | 江苏 | 南京 | 是 |
1、中国药科大学简介
中国药科大学（China Pharmaceutical University），位于江苏省南京市，是中华人民共和国教育部直属的多科性重点大学，是国家“双一流”建设高校、国家“211工程”和“985工程优势学科创新平台”建设高校，入选国家“111计划”、教育部“卓越工程师教育培养计划”、国家大学生创新性实验计划、国家级大学生创新创业训练计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、国家级新工科研究与实践项目，中美药学院校联盟牵头单位。
学校始建于1936年，原名国立药学专科学校（本科四年制），是中国第一所由国家创办的药学高等学府。1937年迁往汉口，1938年迁往重庆，1946年回迁南京。1950年更名为华东药学专科学校。1952年，齐鲁大学药学系和东吴大学药学专修科并入学校，成立华东药学院。1953年，中南卫生专科学校药剂专修科并入学校。1956年更名为南京药学院。1986年与筹建中的南京中药学院合并，成立中国药科大学。2000年，学校由国家药品监督管理局整体划转教育部管理。2001年，江苏省药科学校并入学校。
2、南京中医药大学简介
南京中医药大学（Nanjing University Of Chinese Medicine），位于江苏省南京市，是教育部和江苏省共建的国家“双一流”建设高校，是教育部、江苏省人民政府与国家中医药管理局三方共建高校、江苏省重点建设高校、江苏省高水平大学建设高校，是世界卫生组织（WHO）传统医学合作中心、国家卫生部确定的国际针灸培训中心、全国首批博士和硕士学位授权单位、全国古籍重点保护单位、全国中医师资进修教育基地、国家建设高水平大学公派研究生项目实施高校、国家“特色重点学科项目”建设高校、国家“卓越医生（中医）教育培养计划”改革首批试点高校、国家级人才培养模式创新实验区、中国政府奖学金来华留学生接收院校，是世界一流中医药大学建设联盟、长三角医学教育联盟创始成员。
学校始建于1954年，是中国建校最早的高等中医药院校之一，历经江苏省中医进修学校、江苏省中医学校、南京中医学院、江苏新医学院、南京中医学院（恢复建制）等历史时期。1995年，更名为南京中医药大学。2017年9月，南京中医药大学入选国家“双一流”建设高校。
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